Faustin Linyekula grandit et suit des études littéraires et théâtrales à Kisangani. Il s’installe quelque temps à Nairobi et y co-fonde en 1997 avec Opiyo Okach et Afrah Tenambergen la première compagnie de danse contemporaine au Kenya. De retour à Kinshasa en juin 2001, il met sur pied une structure pour la danse et le théâtre visuel, lieu d’échanges, de recherche et de création : les Studios Kabako. En 2006, les Studios Kabako déménagent pour Kisangani et s’ouvrent en plus du théâtre et de la danse à la musique et au cinéma.
Avec sa compagnie, Faustin Linyekula est l’auteur de plus d’une vingtaine de pièces qui ont été présentées sur les plus grandes scènes et festivals en Europe, en Afrique et Amérique du Nord et du Sud. Faustin Linyekula a aussi imaginé des performances pour des musées, comme à New York au MOMA en 2012, au Metropolitan Musem en 2017, à Marseille au Mucem en 2016, au Musée Royal pour l’Afrique centrale en 2018 ou à la Modern Tate à Londres en 2020.
Faustin Linyekula enseigne régulièrement en Afrique, aux États-Unis et en Europe.
À Kisangani, les Studios Kabako accompagnent par la formation, la production, l’accueil en résidence et la diffusion de jeunes artistes congolais et plus largement africains, tout en développant des programmes et ateliers de formation destinés aux jeunes de Lubunga, l’une des six communes de la ville, autour du film et de la production, mais aussi autour des questions environnementales et de développement durable. Un centre pilote de traitement d’eau y a été installé depuis 2018.
Faustin reçoit en 2007 le Grand prix de la Fondation Prince Claus pour la culture et le développement. En 2014, le travail des Studios Kabako à Kisangani est salué par le premier prix de la fondation américaine CurryStone. En 2016, Faustin Linyekula est artiste associé de la Ville de Lisbonne dans le cadre de la Biennale Artista na Cidade. En 2019, il est artiste associé du Holland Festival à Amsterdam et est aussi sur trois saisons depuis septembre 2018 artiste associé du Manège à Reims.
Faustin a reçu en 2019 le grand prix du Global Leadership de la Fondation Tällberg / Eliasson.